虽然探索从未间断，但关于这些粒子的“身世"，以及什么样的物理过程才能把它们加速到如此高的能量等问题一直成谜。在国际物理学界列出的“ 21世纪11个科学问题"中，宇宙线起源之谜位列第五。
“宇宙线起源之所以难寻找，主要是在宇宙线粒子成分中，绝大多数是带电粒子。"高海拔宇宙线观测站项目副经理、中科院高能物理研究所研究员何会海说，宇宙中到处都是磁场，带电粒子在穿过太空时受其影响改变了方向，丢失了发源地的方
向佇口以自、“宇宙线中的伽马射线和中微子不带电，在磁场中穿行不受磁场的偏转，可以指向源的方向。此外，高能量粒子在宇宙磁场中的偏转微小到可以忽略，也可以用来探寻其源头。"何会海说，在地面观测中，伽马射线、中微子、极高能粒子成为寻找宇宙线源的理想信使
由此，也形成了当今国际三大宇宙线研究中心，即位于南美的极高能宇宙线观测站、南极的中微子天文观测站、欧洲的伽马天文观测站。
“但目前还没有一个被证实产生了宇宙线，这正是中国科研团队的机遇所在。"曹臻说。
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